Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Nicn1Q9CQM0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Nicn1Q9CQM0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Nicn1Q9CQM0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Nicn1Q9CQM0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Nicn1Q9CQM0 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Nicn1Q9CQM0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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