Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Rab5aQ9CQD1 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Rab5aQ9CQD1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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Rab5aQ9CQD1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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