Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CQC3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CQC3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9CQC3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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