Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Chmp3Q9CQ10 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chmp3Q9CQ10 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms