Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms