Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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