Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms