Protein–RNA interactions for Protein: Q99M74

Krt82, Keratin, type II cuticular Hb2, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt82Q99M74 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt82Q99M74 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt82Q99M74 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt82Q99M74 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt82Q99M74 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt82Q99M74 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt82Q99M74 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt82Q99M74 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt82Q99M74 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Krt82Q99M74 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt82Q99M74 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt82Q99M74 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt82Q99M74 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt82Q99M74 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms