Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pagr1aQ99L02 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms