Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms