Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Usp11Q99K46 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Usp11Q99K46 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Usp11Q99K46 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Usp11Q99K46 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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Usp11Q99K46 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Usp11Q99K46 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Usp11Q99K46 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Usp11Q99K46 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp11Q99K46 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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