Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 350.3 ms