Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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TirapQ99JY1 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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TirapQ99JY1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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TirapQ99JY1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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TirapQ99JY1 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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TirapQ99JY1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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TirapQ99JY1 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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TirapQ99JY1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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TirapQ99JY1 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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TirapQ99JY1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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TirapQ99JY1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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TirapQ99JY1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TirapQ99JY1 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms