Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms