Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms