Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan1Q99J59 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms