Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Smim11aQ99J19 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Smim11aQ99J19 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Smim11aQ99J19 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Smim11aQ99J19 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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