Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc8b1Q925Q3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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