Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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