Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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