Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Zfp275-202ENSMUST00000114499 6284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 BC024978-201ENSMUST00000108379 7247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Cgnl1-201ENSMUST00000072899 6754 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms