Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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