Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb6Q922F4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms