Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms