Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Rnf183Q8QZS5 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Rnf183Q8QZS5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Rnf183Q8QZS5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Rnf183Q8QZS5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Rnf183Q8QZS5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Rnf183Q8QZS5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Rnf183Q8QZS5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Rnf183Q8QZS5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Rnf183Q8QZS5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Rnf183Q8QZS5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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