Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Hoxc12Q8K5B8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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