Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nsl1Q8K305 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms