Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms