Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms