Protein–RNA interactions for Protein: Q8K249

Cd300e, CMRF35-like molecule 2, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300eQ8K249 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd300eQ8K249 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms