Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Nek9Q8K1R7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek9Q8K1R7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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