Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms