Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nupl2Q8CIC2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms