Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rbm28Q8CGC6 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rbm28Q8CGC6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rbm28Q8CGC6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rbm28Q8CGC6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rbm28Q8CGC6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rbm28Q8CGC6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rbm28Q8CGC6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rbm28Q8CGC6 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rbm28Q8CGC6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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