Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ccdc28aQ8CEI3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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