Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc38Q8CDN8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc38Q8CDN8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc38Q8CDN8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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