Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCM6

Timm21, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim21, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm21Q8CCM6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Timm21Q8CCM6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm21Q8CCM6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms