Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usp20Q8C6M1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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