Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc113Q8C5T8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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