Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms