Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms