Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htatsf1Q8BGC0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Htatsf1Q8BGC0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Htatsf1Q8BGC0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms