Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms