Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem39bQ810L4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms