Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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ChfrQ810L3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ChfrQ810L3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ChfrQ810L3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ChfrQ810L3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ChfrQ810L3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ChfrQ810L3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ChfrQ810L3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ChfrQ810L3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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ChfrQ810L3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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ChfrQ810L3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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ChfrQ810L3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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ChfrQ810L3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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