Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

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Length 1,193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ttll4Q80UG8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ttll4Q80UG8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ttll4Q80UG8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ttll4Q80UG8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ttll4Q80UG8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttll4Q80UG8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll4Q80UG8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ttll4Q80UG8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll4Q80UG8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll4Q80UG8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ttll4Q80UG8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll4Q80UG8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll4Q80UG8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll4Q80UG8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll4Q80UG8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll4Q80UG8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll4Q80UG8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll4Q80UG8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll4Q80UG8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll4Q80UG8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll4Q80UG8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll4Q80UG8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll4Q80UG8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll4Q80UG8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll4Q80UG8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll4Q80UG8 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll4Q80UG8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms