Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms