Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms