Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Scn4bQ7M729 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Scn4bQ7M729 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Scn4bQ7M729 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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