Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms